产品货号:
ALH167
中文名称:
真菌基因组DNA提取试剂盒
英文名称:
Rapid extraction kit for fungal genomic DNA
产品规格:
50T|100T|200T
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒采用DNA吸附柱和新型独特的溶液系统,适合于从真菌组织细胞中快速简单地提取基因组DNA。可在30分钟内完成一个或多个100mg新鲜或20mg干燥的真菌样品DNA的纯化工作。提取过程不需要用到有毒的酚氯仿等有机物抽提,也不需要用到耗时的异丙醇或乙醇沉淀,并能快速高效地去除多糖类、酚类和酶抑制物等杂质,纯化的DNA可直接用于PCR、酶切和杂交等实验。
新鲜或干燥的真菌组织(细胞)磨碎后经裂解液裂解;蛋白质、多糖、细胞残片被沉淀去除;然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,进一步将多糖,多酚和细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。
- 离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。
- 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
- 快速,简捷,单个样品操作一般可在1小时内完成。
- 高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9,可直接用于PCR,Southern-blot和各种酶切反应。
组份 | 50次 | 100次 | 200次 |
RNase A(10mg/mL) | 250μL | 500μL | 1mL |
缓冲液AP1 | 20mL | 40mL | 80mL |
缓冲液AP2 | 7mL | 13mL | 26mL |
缓冲液AP3/E | 15mL | 25mL | 50mL |
漂洗液WB | 13mL | 25mL | 50mL |
洗脱缓冲液EB | 15mL | 15mL | 20mL |
吸附柱AC | 50个 | 100个 | 200个 |
收集管(2mL) | 50个 | 100个 | 200个 |
保存:室温,有效期1年。
- RNase A保存在即用型甘油缓冲液中,常温运输,收到后,不超过25℃室温至少保存6个月,4℃保存12个月,长期保存放-20℃。
- 缓冲液AP1、AP3/E低温时可能出现析出和沉淀,可以在65℃水浴几分钟帮助重新溶解(AP3加入乙醇前可加热,加入乙醇后不可加热),恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
- 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
- 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13000rpm的传统台式离心机。
- 开始实验前将需要的水浴先预热到65℃备用。
- 缓冲液AP3/E中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
- 不同来源的真菌组织细胞材料提取DNA的量会有差异,一般100mg新鲜组织典型产量可达3~25μg。
- 洗脱液EB不含螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可使用水洗脱,但应该确保pH大于7.5,pH过低影响洗脱效率。用水洗脱DNA应保存在-20℃。DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
- 真菌种类复杂,没有一种试剂盒可以提取所有种类的真菌DNA。如果有的真菌多糖多酚含量过于丰富、次级代谢产物太复杂导致本试剂盒效果不佳,可以选择植物基因组DNA快速提取试剂盒(货号:ALH144)提取真菌,一般该试剂盒对于多糖多酚次级代谢产物复杂的真菌DNA提取效果良好。
- 第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记,以免多次加入!
- 第一次使用前请先在缓冲液AP3/E中加入指定量无水乙醇,充分混匀!
- 取适量真菌组织(新鲜组织100mg或干重组织20mg,可适当多取一些样品弥补粘在研钵上的损失)在研钵中加入液氮充分碾磨成细粉。
- 研磨前,可准备一个1.5mL离心管,加入400μL缓冲液AP1和4μL RNase A(10mg/mL)室温备用。
- 转移细粉到前面准备好的1.5mL离心管(已加入400μL缓冲液AP1和4μL RNase A),旋涡振荡,充分混匀帮助裂解。
- 65℃水浴10分钟,在水浴过程中颠倒离心管2~3次,混合样品。
- 此步骤也可室温放置10分钟,但是65℃水浴10分钟产量更高。
- 加入130μL缓冲液AP2,涡旋振荡混匀1分钟,冰上放置5分钟,13000rpm离心5~10分钟,小心吸取上清到一个新的1.5mL离心管,注意不要吸到界面物质。
- 此步骤可以沉淀去除蛋白、多糖等各种杂质。
- 计算上清量,加入1.5倍体积的AP3/E(请先检查是否已加入无水乙醇!),立即振荡混匀。
- 加入AP3/E可能会出现絮状沉淀,但不影响DNA提取。注意将AP3/E直接加入到上清并立即吹打或者振荡混匀。
- 将上一步所得混合物(包括可能出现的沉淀)加入一个吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13000rpm离心30~60秒,倒掉收集管中的废液(先加650μL离心,弃废液,再加入剩余的溶液,再次离心)。
- 加入600μL漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),13000rpm离心30秒,弃掉废液。
- 重复一遍操作步骤7。
- 如果吸附柱膜还呈现较多绿色色素,可添加此步漂洗,向吸附柱AC中加入500μL无水乙醇,13000rpm离心30秒,弃掉废液。
- 将吸附柱AC放回空收集管中,13000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
- 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加50~100μL洗脱缓冲液EB,室温放置3~5分钟,13000rpm离心1分钟。将得到的溶液重新加入吸附柱中,室温放置2分钟,13000rpm离心1分钟。
- 洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果预计和需要产量高,可增大洗脱体积,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不应少于50μL,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。
- DNA可以短期存放在2~8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。
问题 | 原因分析与建议 |
DNA产量低 | 处理材料过量或裂解不完全-建议:使用适量的起始材料,充分研磨或者匀浆结合条件不恰当-建议:步骤5精确估计上清量,加入1.5倍体积AP3/E量要准确 |
RNA残留 | 真菌RNA含量太丰富-建议:提高RNase A处理浓度 |
未提取到DNA | 漂洗液WB中忘加无水乙醇-建议:实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。 |
离心柱堵塞 | 研磨裂解不充分,团块多;裂解物太粘稠;离心力太小-建议:参见步骤2,加一个离心步骤去除;减低起始材料量,不要处理过量,加大离心力 |
洗脱下来的DNA溶液带颜色或膜上有明显的色素残留 | 漂洗次数不够-建议:步骤8完成后,加500μL乙醇再漂洗一遍起始材料太多过量-建议:减少起始处理材料,不要过量 |
洗脱下来的DNA产量低 | 离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇-建议:确保做了步骤9,否则残留乙醇会影响洗脱效率。使用了水或者其它非最佳液体代替洗脱缓冲液-建议:仔细阅读步骤10和注意事项5和只使用洗脱缓冲液EB洗脱。洗脱缓冲液量偏低-建议:使用200μL洗脱缓冲液洗脱 |
A260吸光值异常偏高 | 一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了吸光值-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。 |
DNA下游酶切不能切开或者酶切不完全 | 一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反应-建议:确保做了步骤9,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。 |
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